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人類大腦紡錘形神經(jīng)元轉(zhuǎn)錄圖譜獲解析 激光顯微切割技術(shù)功不可沒

作者:時(shí)間:2022-07-13 15:33:29356次瀏覽

信息摘要:

中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所*近宣布,宿兵研究小組與中南民族大學(xué)中國(guó)人類腦庫(kù)中心合作,使用激光顯微切割和微量樣本RNA測(cè)序技術(shù)分析了人腦扣帶回紡錘形神經(jīng)元的轉(zhuǎn)錄地圖。該項(xiàng)目由中國(guó)科學(xué)院試點(diǎn)項(xiàng)目和國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)重點(diǎn)項(xiàng)目資助。國(guó)際**神經(jīng)生物學(xué)雜志上發(fā)表了相關(guān)成果《Cerebral Co...

      中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所*近宣布,宿兵研究小組與中南民族大學(xué)中國(guó)人類腦庫(kù)中心合作,使用激光顯微切割和微量樣本RNA測(cè)序技術(shù)分析了人腦扣帶回紡錘形神經(jīng)元的轉(zhuǎn)錄地圖。該項(xiàng)目由中國(guó)科學(xué)院試點(diǎn)項(xiàng)目和國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)重點(diǎn)項(xiàng)目資助。國(guó)際**神經(jīng)生物學(xué)雜志上發(fā)表了相關(guān)成果《Cerebral Cortex》上。

  項(xiàng)目介紹

  研究表明,舊大陸猴、猿、人類等靈長(zhǎng)類大腦進(jìn)化出一種新的神經(jīng)細(xì)胞,稱為紡錘形神經(jīng)元(VEN),在人腦中VEN這種神經(jīng)元存在于猴子等更原始的靈長(zhǎng)類中。神經(jīng)生物學(xué)家猜測(cè)VEN可參與人類社會(huì)認(rèn)知能力等**認(rèn)知功能,但由于VEN人們對(duì)大腦分布的局限性(只集中在前腦島和前扣帶回兩個(gè)腦區(qū))和技術(shù)上的局限性VEN確切的功能幾乎一無所知。因此,構(gòu)建這類細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄圖譜是了解細(xì)胞功能的重要基礎(chǔ)。

  宿兵研究組利用激光顯微切割和微量樣本RNA發(fā)現(xiàn)了300多種測(cè)序技術(shù)VEN特殊表達(dá)升降基因,識(shí)別4個(gè)新基因VEN標(biāo)記基因。對(duì)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),這些基因和VEN形態(tài)發(fā)育(如樹突分支、髓鞘化等)與功能(如人類社會(huì)情感疾病等)密切相關(guān)。).人類VEN轉(zhuǎn)錄圖譜的分析為了解神經(jīng)元在靈長(zhǎng)類大腦進(jìn)化和人腦起源中發(fā)揮重要作用提供了重要的基礎(chǔ)數(shù)據(jù),也為研究人類神經(jīng)精神疾病(如自閉癥)的發(fā)病機(jī)制提供了重要信息。

  激光顯微切割技術(shù)在本研究中分離細(xì)胞并提取RNA它起著重要的作用。

  激光顯微切割技術(shù)的發(fā)展歷程

  顯微切割技術(shù)是20世紀(jì)90年代初發(fā)展起來的一項(xiàng)新技術(shù)。它可以從組織切片或細(xì)胞涂層的任何區(qū)域切割數(shù)百個(gè)、數(shù)十個(gè)類似細(xì)胞,甚*單個(gè)細(xì)胞,然后進(jìn)行分子生物學(xué)的后續(xù)研究,如PCR、實(shí)時(shí)熒光定量PCR、蛋白質(zhì)組學(xué)等分析技術(shù)。顯微切割的發(fā)展經(jīng)歷了四個(gè)階段:手動(dòng)直接顯微切割、機(jī)械輔助顯微切割、液壓控制顯微切割和激光顯微切割。

  

  

  

  激光顯微切割平臺(tái)

  徠卡顯微系統(tǒng)官網(wǎng)圖片來源

  1996200年,美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生院國(guó)家腫瘤研究所**開發(fā)了基于近紅外激光熔膜原理的激光捕獲顯微切割技術(shù)DNA、RNA分析。第二年,美國(guó)Arcturus Engineering公司成功開發(fā)了激光捕獲顯微切割系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)了商業(yè)銷售。五年后,激光捕獲顯微切割成功應(yīng)用于植物研究,在生物研究中發(fā)展迅速,應(yīng)用廣泛。激光顯微切割技術(shù)可以直接取出顯微鏡下觀察到的目標(biāo)細(xì)胞。與早期技術(shù)相比,該技術(shù)具有快速、簡(jiǎn)單、準(zhǔn)確、特異性強(qiáng)、精度高、細(xì)胞形態(tài)完整、細(xì)胞分子結(jié)構(gòu)完整等優(yōu)點(diǎn)。

  激光顯微切割原理

  基于近紅外激光,激光顯微切割可分為激光類型和技術(shù)原理(810nm波長(zhǎng))的LCM 紫外激光(337~355)nm波長(zhǎng))的LMD(激光顯微切割)。上述紡錘形神經(jīng)元轉(zhuǎn)錄圖譜項(xiàng)目采用LCM技術(shù)。

  LCM 系統(tǒng)包括倒置顯微鏡、固態(tài)紅外激光二極管、激光控制裝置、控制顯微鏡載體平臺(tái)(固定載玻片)的操縱桿、電耦合相機(jī)和彩色顯示器。用于捕獲目標(biāo)細(xì)胞的熱塑料薄膜(乙烯乙酸乙烯酯,EVA)直徑通常為6mm,覆蓋透明塑料帽,后者和后續(xù)實(shí)驗(yàn)的標(biāo)準(zhǔn) 相匹配0.5ml匹配離心管。

  LCM技術(shù)原理是將機(jī)械臂控制的收集管懸掛在組織切片上方。收集管的塑料帽表面有一層熱塑料薄膜(其*大吸收峰接近紅外激光波長(zhǎng))。在顯微鏡下選擇目標(biāo)細(xì)胞后,發(fā)射低能紅外激光脈沖并立即加熱EVA膜融化與目標(biāo)細(xì)胞粘合,然后迅速凝固。然后目標(biāo)細(xì)胞粘附在塑料帽表面EVA薄膜和塑料帽一起移走。

  將覆蓋熱塑膜的塑料帽懸掛在脫水組織切片的目標(biāo)部位。顯微鏡直接選擇目標(biāo)細(xì)胞,發(fā)射激光脈沖,并立即加熱EVA局部熔化膜。熔化膜EVA膜滲透到切片上的小組織間隙中,并在幾毫秒內(nèi)與目標(biāo)細(xì)胞粘合并迅速凝固。激光脈沖通常持續(xù)0.5~5.0毫秒,可在整個(gè)塑料帽表面重復(fù)多次。當(dāng)組織和薄膜的附著力超過與載玻片的附著力時(shí),大量的目標(biāo)細(xì)胞可以快速分離。在裝有緩沖液的離心管上覆蓋塑料帽,將分離的細(xì)胞轉(zhuǎn)移到離心管中,分析目標(biāo)細(xì)胞的分子生物學(xué)特征,進(jìn)行后續(xù)研究。

  EVA膜約100~200μm厚,能吸收激光產(chǎn)生的大部分能量,瞬間將激光束照射區(qū)的溫度提高到90°C,保持幾毫秒后的快速冷卻,以確保生物大分子不受損壞。低能紅外激光還能避免損傷性光化學(xué)反應(yīng)。

  LCM其優(yōu)點(diǎn)是快速、簡(jiǎn)單、準(zhǔn)確、無污染,適用于任何類型的玻璃,特別是低能接近紅外光,不直接接觸樣品,激光產(chǎn)生的大部分能量被熱塑料薄膜吸收,對(duì)樣品影響較小。

  而LMD該技術(shù)需要在薄膜載玻片或薄膜覆蓋的玻璃載玻片上安裝標(biāo)本切片。脈沖紫外激光(UV-A)物鏡聚焦切片,沿目標(biāo)區(qū)域邊緣移動(dòng)切割,分離選定區(qū)域內(nèi)的細(xì)胞,周圍組織完好。由于紫外激光波長(zhǎng)非常接近生物組織的吸收峰值,常用于切割較厚的樣品組織。

  激光顯微切割技術(shù)應(yīng)用現(xiàn)狀

  目前,激光顯微切割技術(shù)比以往的顯微切割技術(shù)取得了突破,已廣泛應(yīng)用于神經(jīng)科學(xué)、癌癥研究、植物分析、法醫(yī)或氣候研究等領(lǐng)域。該方法也適用于細(xì)胞培養(yǎng)的操作或覆蓋玻璃的顯微雕刻。雖然應(yīng)用越來越廣泛,但也有一些問題需要解決,如設(shè)備成本,組織切片需要固定和染色,這可能會(huì)影響細(xì)胞的狀態(tài)和RNA、蛋白質(zhì)的變化等。

  目前,激光顯微切割平臺(tái),如美國(guó)賽默飛世爾、德國(guó)徠卡、德國(guó)蔡司和瑞士MMI,世界上**個(gè)商用激光捕獲顯微切割系統(tǒng)Arcturus賽默飛世爾于2010年收購(gòu)。賽默飛世爾 旗艦產(chǎn)品ArcturusXT是**一個(gè)基于紅外線的人LCM基于紫外線LMD蔡司,徠卡和MMI目標(biāo)細(xì)胞只能用紫外激光切割和收集。

  ArcturusXT激光捕獲顯微切割系統(tǒng)有一個(gè)可以升級(jí)和擴(kuò)展應(yīng)用程序的開放平臺(tái),以滿足不斷變化的研究需求。例如,其開放的顯微鏡接口允許用戶修改系統(tǒng),增加高分辨率相機(jī),以獲得更準(zhǔn)確的圖像。開放式系統(tǒng)設(shè)計(jì)還實(shí)現(xiàn)了載體平臺(tái)插入板的輕松交換,可以容納神經(jīng)生物學(xué)研究中使用的更大的樣本形式。

  徠卡提供LMD6500和LMD7000激光顯微切割系統(tǒng)利用紫外激光分離顯微鏡下的目標(biāo)區(qū)域,并通過溫和的重力收集樣品。高精度光學(xué)元件用于控制徠卡兩個(gè)系統(tǒng)中激光束的運(yùn)動(dòng)。光束焦點(diǎn)具有自動(dòng)校正功能,可在自動(dòng)模式和交互模式下切換,顯微鏡樣品平臺(tái)和樣品本身保持不變。這種專利方法可以達(dá)到超出想象的精度。

  瑞士MMI公司主推CellEctor Plus和CellCut Plus激光顯微切割系統(tǒng)利用固體紫外激光切割和收集組織切片樣本中的目標(biāo)細(xì)胞。在整個(gè)分離過程中,激光不接觸需要分離的樣本,對(duì)樣本的損壞較小,以確保樣本RNA完整性。該系統(tǒng)用于樣本收集PTP(Predefined Target Positioning)該技術(shù)將粘性管蓋分為多個(gè)區(qū)域,粘附和收集組織切片中的類似細(xì)胞,提高樣品的收集效率,節(jié)約成本;下游核酸和蛋白質(zhì)實(shí)驗(yàn)有足夠的樣本量。

  蔡司的PALM MicroBeam聚焦激光束也用于切割和分離樣本,但它收集樣本的方式更為特殊。細(xì)胞通過激光誘導(dǎo)的壓力波彈入管道。MicroBeam彈射力就像光誘導(dǎo)的微爆炸發(fā)生在你的樣品下,然后沖擊波向上推動(dòng)組織。對(duì)于較大的區(qū)域,MicroBeam也可使用粘性管蓋。請(qǐng)說明轉(zhuǎn)載:

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